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预后模型,绝对是生信研究领域的「定海神针」,永不过时的经典套路! 预后模型 就是用来预测疾病预后好坏的经典研究方法,预后结局有很多, 如好转、痊愈、复发、恶化、伤残、并发症和死亡 等。 肿瘤因为致死率高,因此关于各种肿瘤预后的研究一直以来都是高分期刊的宠儿!预后模型的构建可分为 5 步: 「找预后因子→筛预后因子→预后因子组合→模型判断→价值意义」 。 而这个「预后因子」完全可以通过基因数据挖掘来找,因为比起常规的预后因子,基因层面的预后因子更多更丰富! 数据类型: 各类肿瘤组织的 DNA 、RNA 测序数据 数据来源:广泛、到处都能挖 最出名的就是 Gene Expression Omnibus (GEO) 数据库,这是目前全世界范围内最大的免费公共数据库,存储了大量的高通量基因表达数据。还有像 TCGA、EMBL-EBI、NGDC 等数据库,也储存了
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