空转数据结构-SpatialExperiment对象介绍（一）

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教程首页 教程地址：https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/SpatialExperiment/inst/doc/SpatialExperiment.html 数据结构 导言 SpatialExperiment类是一个用于存储空间组学实验数据的R/Bioconductor的S4类对象。该类扩展了单细胞数据的SingleCellExperiment类，以支持从基于点和基于分子的平台存储和检索附加信息，包括空间坐标、图像和图像元数据。10x Genomics Visia平台的数据包括一个专门的构造函数。 AI补充知识点 下面的示意图说明了SpatialExperiment类的结构。 图1：SpatialExperiment结构概述 如图所示，对象包括： （i）包含基因表达计数的数据-assays （ii）包含特征信息（即基因）的rowData （iii）关于spots或细胞的colDatacon信息，包括非空间和空间元数据 （iv）包含空间坐标-spatialCoords （v）imgDatacon图像数据。 对于基于spot的ST数据（例如10x Genomics Visia），使用名为计数（coun ………………………………