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“生信零代码”时代来临:Cell的分析照样零基础做

谷粉学术  · 公众号  · 广告  · 2024-09-05 08:19

主要观点总结

本文介绍了生物信息学(生信)的火热程度以及相关应用,特别强调了TCGA数据库在生信研究中的重要性。文章还提到了针对科研人员的生信零代码分析平台——科研者之家,该平台整合了多个公共数据库,提供了强大的样本筛选功能和多种分析模块,极大提高了科研效率。文章最后提供了平台的联系方式和相关信息。

关键观点总结

关键观点1: 生物信息学(生信)的火热程度及应用

文章介绍了生信的火热程度,通过TCGA数据库为例展示了生信在癌症研究中的应用,以及相关文献的指数级增长。

关键观点2: 科研者之家平台的介绍

文章重点介绍了科研者之家平台,该平台整合了多个公共数据库,提供零代码生信分析,包括样本筛选、单样本分析、多样本分析和复杂分析等功能模块,极大提高了科研效率。

关键观点3: 平台的特色和优势

文章详细阐述了平台的特色和优势,包括可视化分析工具、数据分析结果的准确性和可靠性、提供原始数据下载、图文例、方法学、结果的中英文对照和参考文献等,为科研工作者提供了极大的便利。


文章预览

作为科研者,如果你到现在还不知道 生物信息学 ,那真的太out了,生信有多火?拿最有名的数据库TCGA( Cancer Genome Atlas )来说, 目前已经收录了来自1万多例病人的33种癌症的数据,2.5PB的数据量。 在pubmed中随便搜一个TCGA,就可以发现近年来相关文献发表量在成指数级增长。 这其中,一部分是利用TCGA数据库发表的纯生信文章,比如 2018年4月 发表在Cell上的一篇 “ Comprehensive Characterization  of Cancer Driver Genes and Mutations ”。 也有很多利用TCGA数据库的图片给文章增色的, 比如 2019年3月4,耶鲁大学 陈列平 教授团队在 Nature Medicine 上发表题为 Siglec-15 as an immune suppressor and potential target for normalization cancer immunotherapy  的文章,里面就利用TCGA数据库分析了Siglec-15 和T cell signature genes (CD3E, IFNG, GZMA and GZMB) 在膀胱癌中的关系。 而这些都不需要额外的湿实验,大 ………………………………

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