读书笔记 | 微阵列数据的网络分析，理论基础知识

文章预览

书名 ：Microarray Data Analysis    编辑 ：Giuseppe Agapito    年份 ：2022   出版社 ：HUMAN PRESS   ISBN ：ISBN 978-1-0716-1839-4    微阵列数据的网络分析 作者 Alisa Pavel, Angela Serra, Luca Cattelani, Antonio Federico,and Dario Greco 摘要 DNA微阵列 被广泛用于研究 基因表达 。尽管传统的微阵列数据分析基于 差异表达基因 的研究，但众所周知，基因并非单独起作用。 网络分析 可用于研究生物系统中基因的 关联模式 。此外，它在不同系统之间的 差异共表达分析 中具有广泛应用。 基于网络的共表达研究已被用于（复杂） 疾病基因优先排序 、 疾病亚型划分 和 患者分层 。 在本章中，我们概述了用于从微阵列数据创建网络的方法和工具，并描述了多种分析 单个网络 或 网络组 的方法。所描述的方法涵盖从 拓扑指标 、 功能组识别 到 数据整合策略 、 拓扑通路分析 以及 图模型 ………………………………