Nat. Biotechnol. | CRISPR-StAR可在复杂的体内模型中实现高分辨率基因筛选

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大家好，今天为大家推荐一篇发表在Nature Biotechnology上的文章，题目为“CRISPR-StAR enables high-resolution genetic screening in complex in vivo models”。通讯作者是来自 IMBA分子工程研究所的Ulrich Elling，其课题组致力于基因组学和测序分析方面的研究。 细胞群的遗传异质性和瓶颈效应为传统CRISPR-Cas9技术在体内模型中的全基因组遗传筛选带来巨大挑战。遗传异质性指肿瘤内部的细胞并非都是相同的，它们可能含有不同的基因突变、表达水平和环境响应性；瓶颈效应在遗传筛选中意味着如果只有少数细胞能成功移植，这些细胞所代表的sgRNA可能无法准确反映整个基因库的遗传效应。两者共同作用使体内模型的CRISPR-Cas9基因筛选分辨率受限，结果噪声大、可重复性低。 为解决上述问题，本文作者开发了一种名为CRISPR-StAR（Stochastic Activation by Recombination）的新型遗传筛选 ………………………………