6+单细胞+WGCNA+空转，错过这篇的范文就是错过了全世界~

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Single-cell and spatial analyses revealed the co-location of cancer stem cells and SPP1+ macrophage in hypoxic region that determines the poor prognosis in hepatocellular carcinoma”，这篇文章发表在 NPJ Precis Oncol 期刊上，影响因子为6.8。 结果： HCC中CSC的 景观 本研究的工作流程如图所示。图1a.1一个.首先，研究了HCC中CSC的景观。共 45 个 HCC 样本来自GSE151530和GSE149614进行了分析，鉴定了 81,508 个细胞进行单细胞分析。根据精选的经典标志物将细胞分为六个主要簇：上皮细胞、髓系细胞、成纤维细胞、内皮细胞、T 细胞和 B 细胞（图 1b）对离散的恶性细胞进行inferCNV分析。从热图来看，没有上皮亚簇显示出与加标对照细胞相似的拷贝数变异 （CNV） 模式，因此所有上皮细胞都被标记为恶性细胞（图 1c）由于恶性细胞数量少（n < 100），25 个样本被排除 ………………………………