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如何优雅可视化基因簇(座)?

生信益站  · 公众号  ·  · 2024-09-25 08:00

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生信益站,一点就有益 ! 祝友友们天天开心,月月发 CNS~ 设我为🌟星标,每天就能第一时间看到推送啦~ ❝ 事情是这样的,有友友在问 基因簇(座) 的 可视化 方法,今天就给大家 安利一款小巧精致的绘图工具 —— geneviewer geneviewer 是一个用于绘制 基因簇 和 转录本 的 R 包。它从 GenBank 、 FASTA 和 GFF 文件导入数据,执行 BlastP 和 MUMmer 比对,并在基因箭头图上显示结果。该包提供广泛的自定义选项, 包括图例、标签、注释、比例、颜色、工具提示 等。要探索所有功能,请访问官网: https://nvelden.github.io/geneviewer/index.html 安装 geneviewer仍处于开发阶段,可能会导致重大变化,因此尚未在 CRAN 上发布。你可以使用以下命令从GitHub安装开发版本: # install.packages("devtools") devtools::install_github( "nvelden/geneviewer" ) 用法 下面的示例演示如何使用 geneviewe ………………………………

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