snATAC联合scRNA揭示小鼠肾脏细胞分化程序和疾病靶点

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一、写在前面 本次分享的是2021年4月发布于《Nature Communications》的题为" Single cell regulatory landscape of the mouse kidney highlights cellular differentiation programs and disease targets "的文章。确定在肾脏中产生独特细胞类型的表观遗传程序对于理解组织稳态和损伤反应期间的细胞类型异质性至关重要。在这里，作者在单细胞分辨率下对发育中和成年小鼠肾脏的开放染色质( scATAC分析学习手册 )和基因表达( scRNA-Seq学习手册Seurat V4修订版 )进行了分析。作者展示了基因表达对远端调控元件（增强子）的关键依赖性。作者揭示了肾脏细胞的关键细胞类型特异性转录因子和主要基因调控回路。在肾小管前体细胞分化过程中，染色质和表达的动态变化表明足细胞的承诺发生得较早，并且与持续的Foxl1表达相关。肾小管细胞遵循更复杂的分化过程，其中Hfn4a与近端命运相关，而Tfap2b ………………………………