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生命科学前沿  · 公众号  ·  · 2024-11-08 00:02
    

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生物分子动力学模拟是生命科学研究的一项基础技术,其实用性取决于其准确性和高效性。经典分子动力学模拟速度快,但缺乏化学精度。密度泛函理论等量子化学方法可以达到化学的精度,但不能扩展到支持大型生物分子。 2024年11月6日,微软亚洲研究院Wang Tong、 Shao  Bin共同通讯在 Nature 杂志在线发表了题为 “ Ab initio characterization of protein molecular dynamics with AI2BMD ” 的研究论文, 该研究 介绍了一种基于人工智能的从头算生物分子动力学系统(AI 2 BMD),该系统能够以从头算的精度高效地模拟全原子大分子。 AI 2 BMD 使用蛋白质碎片方案和机器学习力场7来实现对包含超过10,000个原子的各种蛋白质的能量和力计算的广义从头算精度。与密度泛函理论相比,它将计算时间减少了几个数量级。通过数百纳秒的动力学模拟, AI 2 BMD 展示了其有效探索肽和蛋 ………………………………

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