Nature | 可解释的深度学习模型帮助发现新结构类型的抗生素

文章预览

MIT James J. Collins等研究人员开发新策略，解释基于图神经网络 （graph neural networks, GNN） 的深度学习模型对潜在抗生素小分子的预测，挖掘能解释预测结果的分子 “亚结构 （substructures） ” ；从而，不是简单筛选孤立的的潜在抗生素小分子，而是挖掘新结构类型抗生素[1], [2]。 该策略的关键是：1. 使用更 “理解” 原子关联的图神经网络架构；2. 大量 （39,312） 且多样的小分子训练数据集；3. 图形搜索算法 （graph search algorithms） 解析潜在支撑其活性的 “亚结构”[2]。 可解释的深度学习模型帮助发现新结构类型的抗生素[2]。 研究人员进一步分析该方法筛选的新类型抗生素潜在工作机制，以及在体 （小鼠） 对耐药菌的效果[2]。 该项工作2023年12月21日发表在nature[2]。 Comment(s): 该策略或许还能用于筛选抗癌药；毕竟，根据文中数据，不同类型细胞对小分 ………………………………