单细胞与空间转录组测序数据关联分析思路

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在前面的 《 单细胞转录组与TCR/BCR测序数据关联分析思路 》 和 《 单细胞转录组与单细胞ATAC测序数据关联分析思路 》 文章中，我们介绍了单细胞多组学的分析思路与方法，这些技术需要将细胞从组织中分离出来，从而丢失了细胞空间位置和相互作用的信息。近年来新兴的空间转录组技术能够还原组织形态和细胞空间位置信息，但其分辨率通常达不到单细胞级别。因此，通过将这两种强大的技术相结合，可以产生高分辨率的空间单细胞图谱，产生1+1远大于2的效果。今天，我们将探讨它们关联分析的思路并结合案例来讲解思路应用的方法。 关联分析思路 在之前的 《 空间转录组与单细胞转录组关联研究，轻松发表顶级期刊 》 文章中已介绍过整合单细胞转录组和空间转录组数据的两种主要方法和原理 [1] ：去卷积（Deconvolution）和映射（Mapping），其 ………………………………