转录因子调控靶基因的“经典”与“创新”的三层思维，看看你在第几层？

主要观点总结

文章主要讨论了转录因子对靶基因的调控，包括经典模式和非经典模式。经典模式是指转录因子结合靶基因的启动子序列来启动转录。非经典模式则包括转录因子结合非启动子序列导致转录提前终止，以及转录因子不结合DNA而结合RNA或蛋白发挥作用等情况。文章还提到了研究的创新思路和科研思维的重要性，并讨论了如何延续SCI文章的研究角度。

关键观点总结

关键观点1: 转录因子对靶基因的调控经典模式

描述了转录因子通过结合靶基因启动子序列来启动转录的经典调控模式。

关键观点2: 非经典调控模式

介绍了转录因子结合非启动子序列导致转录提前终止，以及转录因子不结合DNA而发挥作用的非经典调控模式。

关键观点3: 科研思维的重要性

强调了科研思维在拓展研究领域和寻找新研究角度中的重要性，通过巨噬细胞转化为肌成纤维细胞等例子说明了这一点。

关键观点4: 延续SCI文章的研究角度

讨论了前期发表SCI文章后，如何延续研究并寻找新的研究角度，包括通过直播形式分享课题和文章思路。

文章预览

转录因子对靶基因的调控是分子机制研究中最为经典的一类，一般的 “ 经典 ” 调控模式是： 转录因子 A 蛋白通过结合靶基因 B 的启动子（ DNA ）序列，从而启动靶基因 B mRNA 的转录。 在实验设计中，为了证明转录因子对靶基因的转录调控作用，一般需要设计三个实验： 1. ChIP-Seq/Cut-Tag ：通过对转录因子蛋白进行 ChIP-Seq 测序，分析在靶基因启动子序列上的转录因子的结合峰； 2. DNA EMSA 实验 ： EMSA 实验是体外验证核酸（ DNA 和 RNA ）与蛋白结合的实验，因此靶基因的启动子 DNA 序列如果与转录因子蛋白结合，电泳速度就会变慢；以此类推，在研究 RNA 与蛋白结合的时候还可以做 RNA EMSA 实验。 3.   双荧光素报告基因实验 ：通过靶基因启动子序列构建到报告基因（荧光素酶）前端，从而通过荧光信号确定转录因子对靶基因启动子序列的结合。 其中 ChIP- ………………………………