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全面的人类癌症空间转录组学数据库

生信人  · 公众号  · 生物  · 2024-08-09 07:05
    

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今天给各位介绍这一篇 哈医大Juan Xu教授 等人发表在 Nucleic Acids Research 上的文章。该团队利用空间转录组学数据集成数据库,并可提供五个主要分析模块以解决空间转录组学分析的主要需求,包括切片注释,空间可变基因的鉴定,免疫细胞和肿瘤细胞的共定位,功能分析和细胞间通信。究竟怎么样,我们一起看看吧! 添加微信 精彩推送不错过 一、 研究背景 肿瘤细胞与微环境的相互作用在肿瘤的发生、发展和转移过程中起着关键作用。而空间转录组学技术的出现为揭示癌症中细胞状态和细胞-细胞相互作用的复杂动力学提供了机会。目前可用的空间转录组学数据主要由基于测序的技术生成。但由于缺乏互动工具和癌症类型,它们的可用性受到限制。因此,需要一个全面的癌症空间转录组资源,以交互式可视化和分析空间转录组数据。在此基础上, ………………………………

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