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许菲/曹泽星/范仕龙Angew:设计高活性和热稳定性的甲基对硫磷水解酶

催化进展  · 公众号  ·  · 2024-08-17 09:40
    

主要观点总结

本文介绍了一项关于提高中亲有机磷酸盐降解酶甲基对硫磷水解酶(MPH)活性和热稳定性的研究。研究者采用了一种双焦点方法,通过分层聚类算法确定候选热点突变位点的优先级,并进行了平行迭代筛选。最终得到了耐热的突变体MPHasem5b,该突变体具有商业应用潜力。

关键观点总结

关键观点1: 研究背景与目的

工业发酵应用需要高稳定性和活性的酶,但改善这些特性通常受到稳定性和活动性之间权衡的限制。本研究旨在克服这一挑战,同时提高酶的活性和热稳定性。

关键观点2: 研究方法与过程

研究者采用双焦点方法,结合分层聚类算法和平行迭代筛选,对MPH进行定向诱变。通过预测和虚拟筛选热点残基,进行靶向诱变,最终得到耐热的突变体MPHasem5b。

关键观点3: 研究结果与亮点

研究结果显示,突变体MPHasem5b具有较高的活性和热稳定性。系统晶体学分析、MD模拟和QM/MM计算表明,突变能够增加蛋白质相互作用,重塑活性位点入口,拓宽底物通道,增强蛋白质表面刚性。该研究为克服蛋白质工程中稳定性与活性权衡的长期挑战提供了战略创新。

关键观点4: 研究团队与通讯作者

该研究由许菲、李迎楠、付玉庄等人共同完成,通讯单位为江南大学、厦门大学和清华大学。


文章预览

第一作者:Yingnan Li、Yuzhuang Fu 通讯作者:许菲、曹泽星、范仕龙 通讯单位:江南大学、厦门大学、清华大学 研究背景与内容 ‍ 工业发酵应用通常需要在高温下表现出高稳定性和活性的酶。然而,同时改善这些特性的努力通常受到稳定性和活动性之间权衡的限制。 本报告描述了一种提高中亲有机磷酸盐降解酶甲基对硫磷水解酶(MPH)活性和热稳定性的计算策略。作者为每个残基构建了与目标属性相关的特征库,然后通过分层聚类对候选位点进行优先级排序。 本文要点 要点1.  根据双焦点方法,作者开发了一种分层聚类算法,根据残基的物理性质来确定候选热点突变位点的优先级,这些位点可能会提高稳定性和活性。然后,作者通过平行迭代筛选将每个特性的突变顺序组合在一起,得到了耐热、高效的突变体MPHasem5b,该突变体在蛋白质表面以下和催 ………………………………

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