单细胞分析在eQTL-pQTL数据挖掘中的应用

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今天分享一下单细胞分析在eQTL-pQTL数据挖掘中的应用，很多人想将单细胞分析与eQTL-pQTL数据挖掘联系起来，但是不知道怎么样入手，下面分享一下单细胞分析在eQTL-pQTL数据挖掘中的应用步骤与思路。 单细胞分析在eQTL-pQTL数据挖掘中的应用无非就两个方面，第一就是单细胞分析在最后： 使用单细胞分析验证；第二就是将单细胞分析放在最前面：利用单细胞分析筛选靶点基因。 第一种情况的应用：先使用eQTL、pQTL数据挖掘确定好靶点基因， 再使用单细胞分析验证 第二种情况的应用： 利用单细胞初步筛选靶点基因， 然后使用eQTL、pQTL数据挖掘进一步筛选和验证 单细胞分析在eQTL-pQTL数据挖掘中应用的分析详细步骤如下： 1、从GEO数据库上下载单细胞数据 2、数据过滤与标准化处理 3、线性降维与细胞聚类PCA 4、细胞非线性降维t-SNE、UMAP 5、寻找marker基因 6 ………………………………