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Science | 5'端单细胞测序绘制CD4+T细胞双向转录增强子多模态图谱

单细胞测序网  · 公众号  ·  · 2024-07-09 08:31
    

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导语 增强子是远端顺式调节元件,可增加靶基因的表达。增强子转录的Enhancer RNA(eRNA)可用于测量增强子活性,并在核苷酸分辨率下描绘增强子结构。在单个人类细胞中分析转录增强子可以深入了解细胞类型特异性基因调控和对疾病的遗传易感性。然而,目前仍然缺乏与疾病相关的细胞类型中eRNA的综合图谱。 单细胞测序网讯 :2024年7月5日,日本理化学研究所Chikashi Terao、Kazuhiko Yamamoto与Yasuhiro Murakawa团队共同在 Science 上发表了题为“ An atlas of transcribed enhancers across helper T cell diversity for decoding human diseases ”的研究论文,利用5’端单细胞RNA测序方法构建T细胞双向转录增强子多模态图谱。 研究人员首先对来自三个健康供体的CD4+ T细胞进行了5’单细胞测序与CITE-seq,鉴定出15个CD4+ T细胞类型和数种膜蛋白(图1A-D),其中包括表达NSF的naïve-like CD4+ T细胞 ………………………………

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