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BD测序平台数据初探

生信漫漫学  · 公众号  ·  · 2024-11-18 18:33

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写在开头 之前整理的文献基本上都是10X平台的测序数据,hhh因为作为初学者从10X数据入手比较合适 但是不知不觉 #单细胞实战100次 已经更新到77篇啦,所以 不能仅仅停留在10X的数据,也是时候试试别的测序平台数据 接下来 可能慢慢接触了解一下BD平台测序数据吧! 待分析数据集简介 这次这篇 文献是《The effects of TNF-α/TNFR2 in regulatory T cells on the microenvironment and progression of gastric cancer》 ,后续会分享文献阅读笔记和数据分析推文! 在文献的材料与方法部分,很明确的说明用到的是BD平台进行测序的 对应的 单细胞数据是 :https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE172131 从三名胃癌(GC)患者的肿瘤组织和外周血中获得调节性T细胞(Tregs),进行研究分析,总共是6个样品 其实如果对BD测序平台数据熟悉的话,从数据详情的命名中就可以推断是否是BD平 ………………………………

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