湖南大学史俊峰/曾湘祥《自然·通讯》：基于深度学习框架开发的广谱抗菌肽，有效应对耐药细菌感染

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开发强效且广谱的抗菌肽（AMPs）可能有助于克服抗菌药物耐药性危机。我们开发了一个基于肽语言的深度生成框架（deepAMP），用于识别强效、广谱的AMPs。利用deepAMP减少抗菌耐药性并增强AMPs的膜破坏能力， 湖南大学 史俊峰 / 曾湘祥 & 克利夫兰诊所 Feixiong Cheng 在两轮设计中通过交叉优化验证，识别、合成并实验测试了18种T1-AMP（第一层级）和11种T2-AMP（第二层级）候选物。超过90%的设计的AMPs在抑制革兰氏阳性菌（如金黄色葡萄球菌）和革兰氏阴性菌（如肺炎克雷伯菌和铜绿假单胞菌）方面显示出比渗透素更好的效果。T2-9显示出最强的抗菌活性，与FDA批准的抗生素相当。 该研究展示了三种AMPs（T1-2、T1-5和T2-10）与环丙沙星相比显著降低了对金黄色葡萄球菌的耐药性，并对感染铜绿假单胞菌的雌性小鼠皮肤伤口模型中的感染有效。总之，deepAMP加快了 ………………………………