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湖南大学史俊峰/曾湘祥《自然·通讯》:基于深度学习框架开发的广谱抗菌肽,有效应对耐药细菌感染

BioMed科技  · 公众号  ·  · 2024-09-01 19:33

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开发强效且广谱的抗菌肽(AMPs)可能有助于克服抗菌药物耐药性危机。我们开发了一个基于肽语言的深度生成框架(deepAMP),用于识别强效、广谱的AMPs。利用deepAMP减少抗菌耐药性并增强AMPs的膜破坏能力, 湖南大学 史俊峰 / 曾湘祥 & 克利夫兰诊所 Feixiong Cheng 在两轮设计中通过交叉优化验证,识别、合成并实验测试了18种T1-AMP(第一层级)和11种T2-AMP(第二层级)候选物。超过90%的设计的AMPs在抑制革兰氏阳性菌(如金黄色葡萄球菌)和革兰氏阴性菌(如肺炎克雷伯菌和铜绿假单胞菌)方面显示出比渗透素更好的效果。T2-9显示出最强的抗菌活性,与FDA批准的抗生素相当。 该研究展示了三种AMPs(T1-2、T1-5和T2-10)与环丙沙星相比显著降低了对金黄色葡萄球菌的耐药性,并对感染铜绿假单胞菌的雌性小鼠皮肤伤口模型中的感染有效。总之,deepAMP加快了 ………………………………

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