文献分享 ｜Science｜跨物种小脑皮层单细胞空间转录组图谱

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大家好！为大家介绍一篇2024年9月发表在Science的文章，题目为“Cross-species single-cell spatial transcriptomic atlases of the cerebellar cortex”。本文中，作者发展了一种STitch3D的深度学习方法，这个模型能整合多张空间转录组切片用以重建组织三维结构。该方法不仅能从完成了批次效应处理的切片中高效地收集生物差异信息，并且能整合单细胞转录组测序数据来识别组织三维空间中的基因连续表达水平与细胞类型分布。本文的共同通讯作者之一是中国科学院的神经科学研究所的刘赐融。刘赐融博士是中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心的研究组组长，从事转化脑影像的研究。刘赐融团队在狨猴脑领域有着广泛研究，研究工作主要集中在脑类图谱项目及其静息态脑功能，社会经验与压力在大脑发育及疾病中的作用。刘赐融课题组网站：https://marmosetbrainmapping. ………………………………