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Protein 丨针对单细胞多组学数据设计的细胞类型自动注释方法MultiKano

BioArt  · 公众号  · 生物  · 2024-12-15 10:18
    

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单细胞多组学测序技术的迅速发展,使得同时测量基因表达和染色质可及性成为可能,提供了单细胞分辨率下基因调控机制的整体景观。细胞类型注释是单细胞多组学数据分析的核心步骤。常见的细胞类型注释方法是首先进行无监督聚类,然后根据先验知识手动为每个簇分配细胞类型标签。然而,随着被分析的细胞数量呈指数级增长,手动注释方法面临着难以复制且十分耗时的缺点。 另一种更有效且准确的方法是进行细胞类型自动注释,即利用已标注的数据集来训练模型,然后利用训练好的模型注释新生成的数据集。目前,已有多种专为单细胞转录组数据或单细胞染色质可及性数据设计的计算方法。这些单组学注释方法可以应用于单细胞多组学数据的细胞类型注释任务,即利用一种组学类型来确定每个细胞的细胞类型。然而,单组学注释方法未能 ………………………………

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