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厦门大学JCTC | 具有鲁棒性的全原子(AA)/联合原子(UA)/粗粒度(CG)混合模型与模拟退火相结合的诱导拟合对接方法

X-MOL资讯  · 公众号  ·  · 2024-08-09 08:09
    

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英文原题: A Robust Induced Fit Docking Approach with the Combination of the Hybrid All-Atom/United-Atom/Coarse-Grained Model and Simulated Annealing 通讯作者: 王斌举(厦门大学),张于微(南京师范大学) 作者: Dexin Lu, Ding Luo, Yuwei Zhang*, and Binju Wang* 近日, 厦门大学 化学化工学院 王斌举 教授课题组在 Journal of Chemical Theory and Computation 期刊上在线发表研究论文, 采用一种混合的全原子(AA)/联合原子(UA)/粗粒度(CG)模型,结合模拟退火(SA)执行诱导契合对接(IFD),用来优化一些对接中具有挑战性的例子。 分子对接作为一种常用的复合物结构预测工具,在计算生物学和基于结构的药物发现中有着不可或缺的作用。然而,正确预测结合姿势仍然是分子对接的主要挑战,尤其是针对于由于底物结合所诱导活性中心结构显著重组的靶蛋白。近期,厦门大学王斌举团队提出了一种AA/UA/CG-SA-I ………………………………

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