Adv Sci丨张世华/高琳课题组联合开发多重DNA荧光原位杂交数据插补方法ImputeHiFI实现高保真染色质空间位置预测

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基因组在细胞核内折叠成复杂的三维。理解三维基因组结构对于研究基因调控、细胞命运决定和物种进化等至关重要。近年来，单细胞测序和成像技术的进步显著增强了在单细胞水平上研究染色体结构的能力。例如，研究者开发了单细胞 Hi-C技术并应用于探测细胞群体间或某些关键生物过程中染色质结构的细胞间变异性和动态变化。多重DNA荧光原位杂交 （FISH） 成像技术可以追踪数百到数千个基因组位点的空间位置。然而，多重 DNA荧光原位杂交实验涉及多轮杂交和成像，技术限制导致许多探针的成像信号未被检测到。通常，单个细胞中探针的缺失率可高达25%，并且可能达到62%。这种大量缺失严重影响了基因组信息的完整性和后续分析的可靠性。因此，开发一种有效的插补方法来解决多重DNA荧光原位杂交数据中的缺失至关重要。 截至目前，各种实验 ………………………………