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DeepMind再迎挑战者,ESM作者带队6个月超越AlphaFold 3,代码权重全开源

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2024-09-20 21:00
    

主要观点总结

初创公司Chai Discovery发布了名为Chai-1的模型,该模型在药物发现相关任务中表现出色,甚至超越了AlphaFold 3。Chai-1不仅能预测蛋白质,还能对DNA、RNA等进行统一预测。模型开源了模型权重和推理代码,并提供了技术报告。Chai Discovery团队由顶尖人才组成,包括来自OpenAI、谷歌、Meta FAIR等机构的人才。Chai-1的发布引起了行业内的广泛关注,被认为是药物发现的ChatGPT时刻。

关键观点总结

关键观点1: Chai Discovery发布了对打甚至超越AlphaFold 3的模型Chai-1。

Chai-1在药物发现的相关任务中达到了SOTA水平,甚至超过了AlphaFold 3和MetaFAIR的最新模型ESM3。

关键观点2: Chai-1模型的特点。

模型架构和训练策略大体依照了AlphaFold 3的论文,但有一个关键区别是使用所有可用数据训练单个模型而非针对不同评估分别训练。此外,Chai-1是一个原生多模态模型,可以通过prompt接受新数据,如实验得出的结合袋、接触点和对接的约束条件。

关键观点3: Chai-1模型的性能表现。

在预测多聚体结构方面,Chai-1能比基于MSA的AlphaFold-Multimer模型更准确地折叠多聚体。在PoseBusters基准上,Chai-1对配体预测结果的RMSD(均方根偏差)成功率超过了AF3。

关键观点4: Chai Discovery的背景和融资情况。

成立于今年3月的Chai Discovery是一家AI生物初创公司,几天前完成了3000万美元的种子轮融资。融资由Thrive Capital领投,OpenAI和Dimension Capital也参与其中。目前估值已升至1.5亿美元。

关键观点5: 行业内的反响和投资人的观点。

行业内对Chai-1的发布给予了广泛关注。Dimension Capital的投资人Zavain Dar赞扬了Chai Discovery团队在短短几个月内所取得的成就,并表示他们非常看好Chai-1的未来发展。行业内人士普遍认为,开放技术成果对于推动生物学从科学向工程转变至关重要。


文章预览

   新智元报道   编辑:乔杨 【新智元导读】 一家刚成立6个月的初创公司Chai Discovery最近发布了能对打甚至超越AlphaFold 3的模型Chai-1,而且放出了模型权重和推理代码。 不开源的DeepMind这回还能坐得住吗? 距离AlphaFold 3亮相已经过去了4个月,但由于未公布代码且限量访问次数,我们对它的原理、机制和实际效用依旧知之甚少。 DeepMind团队表示要等到发布6个月后,也就是今年11月才会开源。 前两天 3位牛津学霸放出的复现 也仅仅完成了第一阶段,目前只能预测蛋白质,还无法用于DNA、RNA等其他生命分子。 然而,AF3的各路「踢馆者」正纷至沓来。 最近,一家名为Chai Discovery的初创公司发布了他们的最新模型Chai-1,能够对蛋白质、小分子、DNA、RNA、共价修饰等进行统一预测。 原文地址:https://www.chaidiscovery.com/blog/introducing-chai-1 根据基准测试结果,Chai ………………………………

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