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美东时间 9 月 5 日, DeepMind 推出了一款名为 AlphaProteo 的机器学习模型, 该模型可以设计高亲和力的蛋白质结合剂(Protein Binder), 由 DeepMind 蛋白质设计和湿实验室团队完成这项工作。蛋白质结合剂在结合癌症靶标;阻断病毒感染;调节免疫反应等方面表现出潜力。但传统的识别有效蛋白质结合剂的方法需要大量的实验室工作。 在这项研究中,AlphaProteo 实现了为多种目标蛋白生成高亲和力的蛋白质结合剂,包括与癌症和糖尿病视网膜病变相关的 VEGF-A。这也是 AI 工具首次能够成功设计 VEGF-A 蛋白结合剂。 AlphaProteo 经过蛋白质数据库(PDB)中的大量蛋白质数据和 AlphaFold 中的 1 亿多条预测结构的训练,了解分子相互结合的无数方式。给定目标分子的结构和该分子上的一组首选结合位置,AlphaProteo 就会生成一个候选蛋白质,与目标蛋白结合。 图 | 预
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