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新课第二期 | 单菌基因组组装、注释、遗传表征、分子分型、系统进化和传播溯源

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2025-02-05 21:00
    

主要观点总结

本文介绍了易生信培训团队针对微生物全基因组测序(WGS)的数据分析课程的内容和适用范围。课程涵盖了单菌基因组的组装、注释、遗传表征、分子分型、系统进化和传播溯源等方面。报名参加了线上直播课的老师可以选择参加同课程的线下课程。文章还介绍了课程的资源和模式,包括提供的计算平台、课件、流程代码、生信软件等。

关键观点总结

关键观点1: 课程内容

课程利用全基因组测序(WGS)数据及生信方法,旨在研究属于单个微生物物种的特征菌株或病原体毒株基因组,包括基因组组装、基因注释、遗传表征、分子分型、系统进化和传播溯源等方面。

关键观点2: 课程适用范围

课程适用于微生物学、进化生物学、传染病/流行病学、临床微生物检验、公共卫生领域的相关学生或研究人员。课程不适用于大型动/植物基因组的分析。

关键观点3: 课程资源和模式

课程提供了计算平台、课件、流程代码、生信软件等资源。直播与回放、流程和代码等模式帮助学员快速部署流程,熟悉操作方法,强化编程技能,完善理论学习,提升专业技能。

关键观点4: 课程安排和特点

课程包括基因组组装、注释、遗传表征等主题,每节课1小时一个主题,理论结合实战。课程提供课前准备工作和详细课程安排,由经验丰富的老师分享。


文章预览

单菌基因组组装、注释、遗传表征、分子分型、系统进化和传播溯源 福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、单物种转录组、单菌基因组的线上/线下同时开课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课 。期待和大家的线上线下会晤。 目前可以通报的信息: 单物种转录组线上/线下开课时间: 2025/03/21-22 临床基因组线上/线下开课时间: 2025/2/21-23 单菌基因组线上/线下开课时间: 2025/3/28-30 宏基因组线上/线下开课时间: 2025/5/9-11 扩增子线上/线下开课时间: 2025/4/11-13 报名链接:http://www.ehbio.com/Training/ 开课背景 微生物 (细菌、病毒和真菌)的全基因组测序 (Whole genome sequencing, WGS)技术已取得了长足的进步,可通过足够低的成本、可观的通量和较短的时间完成 ………………………………

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