插件 | 基于序列的 T2T 基因组的着丝粒区域自动判断

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写在前面 Emmm，基因组组装质量的评估标准有很多，伴随着测序技术的飞速发展，尤其是 pacbio hifi 和 nanopore，现在越来越多基因组可以组装到 T2T 水平。评价一个基因组是否基本达到 T2T 标准，那么需要判断起端粒是否组装出来。换句话说，端粒组装出来多少，甚至说准确与否，可以从一定程度反应基因组组装的质量。 早前，我们做了一点T2T相关工作，并讨论了相关idea。因为是side-project，一直只是说说，等到小朋友毕业答辩后，建立了一个side-project，预期做一个小工具，叫「T2Tvalidator」。 其中包括端粒（这个简单，因为存在保守motif），另一个是着丝粒（这个会麻烦一点点），当然还计划了更多内容，不过，似乎这个工作可以进一步放下，因为昨天，我们看到 Hort Res 期刊推出了一个非常漂亮的工作， 几位老师推出了一个非常实用的工具，提供了 ………………………………