手把手教学｜String数据库与Cytoscape软件联合应用

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一、   简介 STRING数据库（https://cn.string-db.org/）是一款用于分析蛋白与蛋白相互作用（Protein-Protein Interaction，PPI）的常用公共数据库，是一个综合性的在线分析平台。该数据库不仅整合了部分实验验证的结果，亦包含部分经计算预测所得结果，在研究蛋白质功能，不同蛋白之间的相互作用及联系等方面具有重要价值。 Cytoscape是一款常用的可视化分析软件（下载网址：https://cytoscape.org/），可轻而易举地依据实验数据生成可视化网络，方便快捷。 两者联合应用可迅速获取PPI网络图并实现图片美化操作。 本文将以人类“TP53”蛋白为例，简单介绍STRING数据库与Cytoscape软件的联合应用。   STRING数据库主页面展示 Cytoscape界面展示 二、 STRING数据库分析流程 1．进入STRING数据库官网后，点击“SEARCH”，即可进入如下界面，左侧列为我们提供了一些常用的分析 ………………………………