手头肿瘤样本属于TCGA已定义的哪个分子亚型？用这刚开源的700+模型帮你归类

文章预览

前言：是否遇到过同行评议询问你手头的肿瘤样本属于 TCGA 相关研究的哪一分子亚型？是否想要研究肿瘤 TCGA 的分子亚型的生物特征但又苦于无法复现官方原文？是否想要用公开数据集利用 TCGA 的分子亚型来进行其他角度的研究？今天分享的这篇文献或许可以解决这些问题。这边先进行一下简单的导读，详细的文章精读请看同期推文《分子分类 | CancerCell | 使用紧凑特征集对非 TCGA 癌症样本进行 TCGA 分子亚型分类》。 一图千言 简要概述 Ellrott 等人提供了一种方法，可用于将临床试验和其他癌症基因组研究中的患者样本分配到已发布的 TCGA 分子亚型。 他们利用机器学习对 8,791 例 TCGA 肿瘤样本的 五种不同分子平台 数据进行分析，并构建了 737 个高性能分类模型，作为公开资源，为临床检测方法的开发奠定基础。 研究亮点 使用五种机器学习方法 ………………………………