harmony整合“失败”才是正常的

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我们的马拉松授课的单细胞环节给了大家一套适用于几千个单细胞转录组数据集的完整降维聚类分群代码，但是有一些小伙伴在应用于自己感兴趣的研究的时候就出现了一些看起来是bug的结果。 比如咱们九月份的学员就反馈了这个数据集：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE125688 GSM3580367 BEC_ctr1 GSM3580368 BEC_ctr2 GSM3580369 BEC_ctr3 GSM3580370 BEC_DDC1 GSM3580371 HEP_ctr1 GSM3580372 HEP_DDC1 对应的文章是：Single-Cell Analysis of the Liver Epithelium Reveals Dynamic Heterogeneity and an Essential Role for YAP in Homeostasis and Regeneration. Cell Stem Cell 2019 Jul 3;25(1):23-38.e8. PMID: 31080134 这个研究关心的是这两个不同的上皮细胞： hepatocytes and biliary epithelial cells (BECs)，我们很容易下载到不同样品的作者提供的表达量矩阵文件：  ls -lh *gz|cut -d " "  -f 6-   1.7M  1 26  2019 GSM3580367_bil-adult1.coutb. ………………………………