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生信人肯定对单细胞测序不陌生了吧,作为大热门的研究方向那必然有他的独特之处,单细胞测序是从单个细胞水平对转录组进行研究,因此能够更细致的搜寻细微的差别。同时另一个高手空间转录组能够定位和区分功能基因在特定组织区域内的活跃表达,二者侧重点不同但各有各的独到之处,如果结合起来那必然会大放异彩,更全面的进行细胞研究! 今天带来的这篇文章通过 整合单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据,揭示了肝细胞癌(HCC)肿瘤细胞的异质性 ,并探索了高转移潜力肿瘤细胞与肿瘤微环境的相互作用机制,快跟馆长一起来看看吧! 1、使用多种数据整合分析 :整合52个单细胞RNA测序数据和5个空间转录组学数据,建立了HCC恶性细胞的异质性景观。 2、对肿瘤细胞亚型进行识别研究: 在肿瘤细胞中发现了三种亚型,并进一步探讨了这
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