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再刷记录,Q80.83!中科院基因组所康禹课题组完成犹太人二倍体基因组拼装

测序中国  · 公众号  ·  · 2024-03-11 14:45

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日前,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)康禹课题组,采用完全公开的欧洲犹太裔个体HG002的原始测序数据,完成其二倍体基因组的sub-T2T组装(除rDNA区以外,实现端粒到端粒拼接)—— HG002.k1 。 HG002个体测序数据由美国瓶中基因组(genome in a bottle,GIAB)联盟完成并公开(CC0),采用其各版本基因组相同的质量评估方法(包括相同的软件、参数、和相同的评估用测序数据)进行评估, k1版本达到Q80.83(母本:Q82.71;父本Q79.49),再次刷新人类二倍体基因组拼接质量 。与GIAB在2023年10月底发布的HG002v1.0.1(质量为母本Q75.5,父本Q74.7)版本相比,k1版本修正了263 处拼接错误,其中母本116处,父本147处,包括母本10号染色体上一段长达13.8kb的缺失,所有修正都有充足的测序数据支持。 目前k1版本基因组序列已经上传亚马逊云,说明文档 ………………………………

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