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代码分享|| Nature肝脏疾病进展单细胞分析超详细代码:上游分析+下游,详细到fq文件重命名,数据预处理等!快上车!

生信技能树  · 公众号  ·  · 2024-07-11 08:15

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本次分享的文献是一篇 2024年5月份发表在Nature 上的单细胞转录组数据分析, 同样代码非常的详细文献 !!! 包括上游分析+下游, 详细到fq文件重命名 ,数据预处理等!Fig1、2、3等的绘制。高级分析如细胞通讯分析,拟时序分析,RNA速率分析等。 数据和代码 单细胞数据: GSE202379 代码: https://github.com/Core-Bioinformatics/MASLD-NASH 代码一瞥: fq重命名: image-20240621182204240 数据预处理: image-20240621182125185 unset unset 文章主要内容: unset unset 研究团队: 剑桥NIHR生物医学研究中心Michael Allison、剑桥大学Wellcome-MRC剑桥干细胞研究所Irina Mohorianu和Ludovic Vallier 本研究对 47例不同阶段的代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)患者的肝脏活检进行了单核RNA测序(snRNA-seq) ,以建立疾病进展过程中肝脏的细胞图谱。然后,作者将这些单细胞水平的数据与先进的3D成像相 ………………………………

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