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10X数据分开读取与整理

生信漫漫学  · 公众号  ·  · 2024-10-05 09:30

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写在开头 hhh国庆快乐呀宝子们,之前已经整理过 10X格式单个样品分开读取 ,也就是 当有这种虽然是10X数据,但是分开为三个不是标准的格式存放的格式,一般会将其按照对应的格式读取进来,然后修改行列名字。 之前陆陆续续 基于V4版本以及V5版本的Seurat包,整理过单细胞不同数据格式的读取方式 不同格式单细胞数据下载及读取分析流程 单细胞数据获取及格式介绍 V5版seurat读取不同格式单细胞数据 以及过来学习的 学徒整理的超详细的笔记 —— 不同文件格式单细胞数据读取流程 但是这次处理的 SCP393这个数据,稍微有点点特殊 。首先提供了两个版本的数据集,本着选多不选少的原则,选择了标记为1的数据集 下载数据后,因为提供的是三个分开并且不是标准格式的文件,所以分开读取再整理。 分开读取数据并查看 按照之前的方法,依次将需 ………………………………

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