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北京大学王劲卓团队提出DrugLAMP模型,通过多模态预训练语言模型进行药物-靶点相互作用预测

智药邦  · 公众号  ·  · 2025-01-13 08:00
    

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准确预测药物-靶点相互作用(DTI),特别是准确预测新的靶点或药物的相互作用,对于加速药物发现至关重要。预训练语言模型(PLM)和多模态学习的最新进展,为利用大量未标记的分子数据和整合来自多模态的互补信息来增强DTI预测,提供了新的机会。 2024年11月21日,北京大学王劲卓老师团队在Bioinformatics上发表文章Accurate and transferable drug–target interaction prediction with DrugLAMP。 作者提出了DrugLAMP(pretrained Language model-Assisted Multi-modal Prediction for drug-target interaction,通过多模态预训练语言模型进行药物-靶点相互作用预测)。 DrugLAMP是一个基于预训练语言模型(PLM)的多模态框架,集成了PLM和传统特征提取器提取的分子图和蛋白质序列特征。 作者引入了两个新的多模态融合模块:(i)口袋引导共同注意力(PGCA),它使用蛋白质口袋信息来指导对药物特 ………………………………

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