AlphaFold3｜能否预测蛋白突变亲和力变化？

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AlphaFold3｜能否预测蛋白突变亲和力变化？ 本月5月8日，预测所有分子相互作用结构的AF3文章发表在nature。才二十天左右时间，来自上海交通大学郑双佳老师和中山大学的研究团队，发表了一篇benchmark， 旨在回答一个问题：AF3能不能预测蛋白-蛋白突变效应导致的亲和力变化？ 论文速览 科学问题 如何准确预测突变对蛋白质-蛋白质相互作用的影响，特别是亲和力ΔΔG的变化？ 总结速览 本论文在SKEMPI数据集上，将AlphaFold3的置信度指标与其他(基于物理/AI等)亲和力预测基线进行对比，对比这些算法在预测蛋白蛋白突变亲和力ΔΔG的准确性，算是一个benchmark文章。AF3在此数据集上PR相关性为0.49。 关键词 AlphaFold3｜蛋白突变｜亲和力｜SKEMPI数据集 正文内容 数据集 本文使用 SKEMPI 2.0 数据集，这是一个包含实验测量的蛋白质突变对结合亲和力影响的基准数据集 ………………………………