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颜宁团队再发PNAS:新年第一篇,开启领域研究新方向!

募格学术  · 公众号  · 科研  · 2025-01-03 17:10
    

主要观点总结

冷冻电镜技术和人工智能工具的进步推动了结构生物学领域的革命性发展。现在,科学家们能够以前所未有的方式探索未知的生物实体。深圳医学科学院颜宁教授团队采用名为CryoSeek的策略,结合了冷冻电镜、AI辅助的自动建模和生物信息学分析,发现了自然界中完全未知的新型生物实体。该团队在淡水样本中发现了糖蛋白纤维,并对其进行了详细的cryo-EM分析。研究表明,糖蛋白纤维的结构完全由聚糖维持,并且可能在生物组装中发挥重要作用。此外,这一发现为训练基于人工智能的工具提供了宝贵的数据集,有助于精确聚糖结构预测、模型建立和结合剂设计。颜宁教授团队表示,这一新发现标志着他们实验室新方向的开始,并展示了CryoSeek策略在寻找生物实体以及为碳水化合物的结构研究建立原型方面的潜力。

关键观点总结

关键观点1: 冷冻电镜和人工智能技术结合为探索未知生物实体提供了前所未有的机会。

颜宁教授团队采用CryoSeek策略,结合冷冻电镜、AI辅助的自动建模和生物信息学分析,发现了新型生物实体。

关键观点2: 颜宁教授团队在清华荷塘淡水中发现了糖蛋白纤维,并对其进行了详细的cryo-EM分析。

研究发现糖蛋白纤维结构完全由聚糖维持,可能在生物组装中发挥重要作用。

关键观点3: 这一发现对聚糖在生物组装中的结构作用提供了有价值的见解,并展示了CryoSeek策略在寻找生物实体和建立碳水化合物结构研究的原型方面的潜力。

此外,该发现为训练基于人工智能的工具提供了宝贵的数据集,有助于精确聚糖结构预测、模型建立和结合剂设计。


文章预览

本文来源:生物世界 撰文丨王聪 冷冻电镜 (cryo-EM) 技术带来了分辨率革命,让我们能够以原子级的高分辨率观察并描绘蛋白质结构。基于 人工智能 (AI) 的AlphaFold等工具实现了对蛋白质结构的快速且精准的预测,如今,AlphaFold已经预测了地球上几乎所有已知的蛋白质的结构。 从历史上来看, 结构生物学 (Structural Biology) 一直专注于研究已知物质。而现在,结构生物学正经历着一种范式转变——从靶向结构确定到结构引导的发现先前未被表征的生物实体。而冷冻电镜的高分辨率能力以及人工智能的结构预测能力,为探索完全未知的生物实体提供了前所未有的机会。 最近, 深圳医学科学院 颜宁 教授团队 接连发表了几篇论文,提出了一个名为 CryoSeek (酷寻) 的新策略, 将冷冻电镜作为一种观察工具,结合AI辅助的自动建模和生物信息学分析 ………………………………

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