生信数据预处理的Linux三大神器

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阅读此文前，强烈建议先去了解一下正则表达式。 正则表达式(Regular Expression,RE,regex)是一个强大字符串操作引擎，可用于检索、替换那些符合某个模式(规则)的文本的。 grep:最快的文本搜索工具 如果你想要成功，就要做到你所在领域的最好。——中二的hoptop grep就是在文本提取和匹配上最快的工具，因为它只有一个目标，在每一行找匹配的内容，并且在这个任务上没有其他程序比他是做的更好。 继续以拟南芥基因组和注释文件作为练习对象。 wget -c -4 -q http://www.arabidopsis.org/download_files/Genes/TAIR10_genome_release/TAIR10_chromosome_files/TAIR10_chr_all.fas   & wget -c -4 -q http://www.arabidopsis.org/download_files/Genes/TAIR10_genome_release/TAIR10_gff3/TAIR10_GFF3_genes.gff & 在注释文件中查找某一个 ………………………………