助力药物发现，北京蛋白质组学研究中心提出基于蛋白质序列的深度迁移学习框架

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将 ScienceAI   设为 星标 第一时间掌握 新鲜的 AI for Science 资讯 编辑 | X 泛素是一种高度保守的小蛋白质，由 76 个氨基酸残基组成，存在于所有真核生物的细胞中。 蛋白质泛素化调节多种细胞过程。蛋白质泛素化的程度由泛素连接酶 (E3) 介导的泛素化和去泛素酶 (DUB) 介导的去泛素化之间的微妙平衡决定。与 E3-底物相互作用相比，DUB-底物相互作用 (DSI) 的研究仍然不够充分。 为了应对这一挑战，北京蛋白质组学研究中心的研究人员提出了 一种基于蛋白质序列的从头算方法 TransDSI，该方法可以在训练数据不充分的情况下，转移蛋白质组规模的进化信息来预测未知的 DSI。 TransDSI 集成了一个可解释的模块，以在预测 DSI 的同时建议 DSI 的关键蛋白质区域。 TransDSI 在交叉验证和独立测试中均优于多种机器学习策略。 TransDSI 通过识别调节性 DSI 为蛋白质提 ………………………………