​PNAS∣中国农业大学汪海团队实现转录调控序列的人工智能设计

文章预览

近日，在“农作物基因资源阐析”国际大科学计划（G2P计划）等项目的支持下，中国农业大学农学院汪海团队联合美国康奈尔大学、丹麦奥胡斯大学、北京大学现代农业研究院、坦桑尼亚农业科学院等单位，在 PNAS 在线发表了题为“ Modeling 0.6 million genes for the rational design of functional  cis -regulatory variants and de novo design of  cis -regulatory sequences ”的研究论文。 尽管转录调控已被发现了半个多世纪，人类仍然无法像理解编码区DNA序列的密码子那样，理解转录调控区DNA序列中每个碱基的功能。如何给DNA序列加上“标点符号”以定义motif？Motif的数量、类别、方向、组合、顺序以何种数学函数映射到基因的表达量？这些问题（即转录调控区的语法）至今未能总结为普适而简约的定律。这一基础理论问题的滞后限制了三个应用研究领域的发展：（1）如何打破连 ………………………………