细胞图谱 | Nature 的人类细胞图谱基础模型，SCimilarity 框架

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Basic Information 英文标题：A cell atlas foundation model for scalable search of similar human cells 中文标题：一种用于可扩展搜索相似人类细胞的细胞图谱基础模型 发表日期：20 November 2024 文章类型：Article 所属期刊：Nature 文章作者：Graham Heimberg | Aviv Regev 文章链接：https://www.nature.com/articles/s41586-024-08411-y Abstract Para_01 迄今为止，单细胞RNA测序已经对多个器官、疾病、发育和扰动中的数亿个人类细胞进行了分析。 挖掘这些不断增长的图谱可以揭示细胞与疾病之间的关联，识别出在意外组织背景下的细胞状态，并将体内的生物学与体外模型联系起来。 这需要一种跨身体的通用细胞相似性度量标准，以及一种高效的搜索方法。 在这里，我们开发了 SCimilarity，这是一种度量学习框架，用于学习一个统一且可解释的表示形式，使得能够从各种研究中的数千万个细胞谱系 ………………………………