主要观点总结
RNA-seq技术已逐渐成为全转录组水平分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接的重要工具。随着二代测序技术的发展,RNA-seq的应用也越来越广,可应用于单细胞基因表达、RNA翻译和RNA结构组的研究。新的技术如空间转录组学也在积极研究中。RNA-seq帮助人们更好地理解RNA生物学的各个方面,从转录本转录的时间和地点到RNA折叠以及分子互作的功能。文章还介绍了RNA-seq的基础流程,包括建库、测序和数据分析,以及其在单细胞转录组和空间转录组中的应用。最后,文章探讨了RNA-seq的未来,并列举了RNA-seq在RNA生物学关键研究中的应用,包括转录和翻译的动力学分析,RNA结构,RNA-RNA和RNA-蛋白质间相互作用等。
关键观点总结
关键观点1: RNA-seq在转录组分析中的应用
RNA-seq技术已广泛应用于全转录组水平分析差异基因表达,包括单细胞基因表达、RNA翻译和RNA结构组的研究。
关键观点2: RNA-seq的技术发展
随着二代测序技术的发展,RNA-seq的应用领域越来越广,包括单细胞转录组和空间转录组的研究。
关键观点3: RNA-seq在单细胞转录组中的应用
单细胞测序已成为许多实验室的标配,可揭示过去认为研究透彻的疾病中存在的未知细胞类型。
关键观点4: RNA-seq的未来发展
随着技术的进一步发展,长读长测序技术可能取代Illumina的短读长RNA-seq作为默认的研究方法。
关键观点5: RNA-seq在RNA生物学关键研究中的应用
RNA-seq在RNA生物学关键研究中的应用包括转录和翻译的动力学分析,RNA结构,RNA-RNA和RNA-蛋白质间相互作用等。
文章预览
编译 |生信宝典,May 校对 |生信宝典 生物信息学习的正确姿势 NGS系列文章包括 NGS基础 、 高颜值在线绘图和分析 、转录组分析 ( Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这 ) 、ChIP-seq分析 ( ChIP-seq基本分析流程 ) 、单细胞测序分析 ( 重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 ) 、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘 ( 典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) ) 、 批次效应处理 等内容 。 摘要 RNA测序( RNA-seq )在过往十年里逐渐成为全转录组水平分析 差异基因 表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具。随着 二代测序技术 (NGS) 的发展,RNA-seq的应用也越来越广。现已经可以应用于很多RNA层面的研究,比如单细胞基因表达、RNA翻译( translatome )和RNA结构组( structurome 结构组学)。新的有意思的应用,如空间转录组
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