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生信精准科研
这个机器学习方法已经连续发了好几篇高分文章
生信精准科研
·
公众号
· · 2024-07-08 07:28
文章预览
今天跟大家分享发表在 Brief. Bioinformatics(IF:6.8) 杂志上的文章。作者基于基因表达水平的相对高低秩序识别肿瘤干性基因对,发现基于干性指数有助于区分多种肿瘤的分级和预后,具有指导肿瘤治疗的潜力。 人类干性指数与致癌去分化有关 一.研究目的 癌症的进展伴随着干性的获得与分化表型的丧失,而基于转录谱已提出了许多评估肿瘤干性的方法。但是,由于这些评估肿瘤干性的方法仅给出干性指数的相对范围(而非绝对干性指数),亦或是基于基因表达绝对检测值 (由于批次效应等影响,不同实验检测的样本数据并不能简单的直接合并进行分析),使得这些方法无法直观评估肿瘤干性。 研究人员基于基因表达水平的相对高低秩序 (relative expression orderings, REO s)关系识别出基因对,并提出一个绝对干性指数用来量化致癌去分化程度。 ………………………………
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