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学员在微信交流群分享了一个2024年5月的单细胞数据挖掘文章,标题是:《 Single-cell combined with transcriptome sequencing to explore the molecular mechanism of cell communication in idiopathic pulmonary fibrosis 》,研究者们重新分析了 GSE122960 这个单细胞转录组数据集. 第一层次降维聚类分群后简单的统计了一下每个单细胞亚群的数量,绘制条形图如下所示: 就很迷惑,8个单细胞亚群为什么就使用了4个颜色呢? R语言配色大全 我比较喜欢下面的4个r包,简单快捷: RColorBrewer 由Cynthia A. Brewer开发的RColorBrewer包提供了一套精心挑选的颜色方案,特别适合制作地图和数据可视化。 它允许用户根据色盲友好性、颜色数量和颜色类型(如序列、发散和定性)选择颜色方案。 ggsci ggsci(ggplot2 scientific)包允许用户在ggplot2的绘图中使用科学期刊的颜色方案,如《Nature》、《Science》等。
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