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Reading UCSC Genome Browser 一款基因组浏览器 UCSC Genome Browser 于2000年开放,是由加州大学圣克鲁斯分校(UCSC)托管的在线且可下载的一款基因组浏览器。它是遗传工作者进行变异解读必不可少的工具之一,它可以快速而且可靠地显示任何规模的基因组的任何所需部分,并包含数十种可供选择的数据库注释轨迹。 通常我们可以在浏览器底部,通过调整每个数据库的显示状态来设置想要展示的注释轨迹, 也就是 track set 。 对于不同长度的变异如SNV和CNV,参考的关键数据库有较大差异。 怎样配置才能达到最佳最直观的效果呢?? 针对这个问题 近期UCSC提供了 3套推荐的临床track set配置方案 , 分别适用于 ①编码区SNV; ②拷贝数变异CNV; ③非编码区SNV。 下面将进行详细介绍,干货满满,建议收藏! Recommended track set使用方法 通过Menu进入track sets的选择页面;
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