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做生物信息,软件版本太重要了

基因学苑  · 公众号  ·  · 2024-07-23 08:14
    

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开源软件经常更新,在做生物信息时,常常因为软件版本问题造成错误。所以使用每一个软件都要首先记录软件版本。不同版本之间选项参数可能有很大差别,结果也差别很大。 samtools版本问题 经常有人在群里问为什么同样的一条代码,自己的却运行不出来。检查一下,每个字母都一样啊。并不是同样的一条脚本在任何环境下结果都一样。软件的版本是不一样的。比如samtools这个软件,最新版本和之前的老版本差别巨大,连选项参数都有很大的差别。 下面分别是samtools0.1.19版本与1.17版本的对比,二者差别非常大。 图1:samtools 0.1.1 9 版本 图2 :  samtools  1.17 版本 所以不要再说我和你的代码一样为什么报错呢。 查 看系统版本 除了软件版本,系统版本也非常重要。在Linux系统中,可以使用下面命令查看系统版本。 1、lsb_release 命令 如果没有,就安 ………………………………

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