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点击 上方 蓝字 关注我们 在AlphaFold2的开发过程中,该AI模型已经在所有已知的氨基酸序列和蛋白质结构上进行了深入训练。 1. 数据输入与数据库搜索 将一个未知结构的氨基酸序列输入AlphaFold2,系统会在数据库中搜索相似的氨基酸序列和蛋白质结构。 2. 序列分析 AI模型会对所有相似的氨基酸序列进行比对——这些序列常常来自不同的物种——并分析哪些部分在进化过程中得以保留。 接下来,AlphaFold2会探索在三维蛋白质结构中哪些氨基酸可以相互作用。相互作用的氨基酸会共同进化:如果一个氨基酸带电,另一个则会带有相反的电荷,因此它们会彼此吸引;如果一个氨基酸被疏水性氨基酸替代,另一个也会变得疏水。 3. AI分析 通过迭代过程,AlphaFold2会细化序列分析和距离图。该模型使用称为变换器(transformers)的神经网络,这些网络能够高效识
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