专栏名称: 生信钱同学
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DeepTalk模型,NC刚发表的的细胞通讯方法,功能很强大

生信钱同学  · 公众号  ·  · 2024-08-20 07:00

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探索单细胞空间转录组学的新算法——DeepTalk模型的重大突破 昨日,《自然通讯》期刊上发表了一项突破性研究,提出了一种全新的计算模型—— DeepTalk,用于整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学(ST)数据 。这一研究标志着单细胞空间转录组学领域的重要进展,将有助于更深入地理解细胞间的通信和组织微环境中的复杂相互作用。 背景介绍 单细胞RNA测序技术能够捕获个体细胞的转录本表达谱,而空间转录组学则提供了细胞在组织中的空间信息。这两种技术的结合可以揭示组织内细胞间的复杂动态,但由于数据的高维度和异质性,如何有效地整合这两种数据一直是科学界面临的巨大挑战。 DeepTalk模型的创新性 DeepTalk模型由两部分组成: DeepTalk-Integration和DeepTalk-CCC(Cell-Cell Communication)。其中,DeepTalk-Integration主要负责整合scRNA-seq和ST数据 ………………………………

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