Genome Res丨陈亮/单革/王学仁团队系统鉴定并揭示EIciRNA特征及生理关联

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EIciRNA (Exon-intron circRNA) 是一类由外显子和内含子序列共同构成的环形RNA （circRNA） ，因其内含子保留 （intron retention, IR） 特性，而迥异于仅由外显子组成的circRNA （exonic circRNA, EcircRNA) 。EIciRNA由中国科学技术大学单革教授团队首次发现 （Nat Struct Mol Biol，2015，引用超2600次） 。前期已发表的工作通过对EIciRNA特例的研究，发现不同于主要定位于细胞质中的EcircRNA，EIciRNA几乎完全定位于细胞核中，其5’ splice site可与U1 snRNP结合，进而与RNAPII (RNA polymerase II) 复合物相互作用，从而促进亲本基因的转录起始。由于缺乏可靠的生物信息学工具，EIciRNA 的总体特征及其在生理病理中的功能、机理未得到持续探索。值得一提的是，与研究得较为充分的线性转录本中的内含子保留 （retained introns in linear RNAs, LIR） 相比，对环形RNA内含子保留 (retained introns of circRNA ………………………………