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文章亮点： 1.多组学方法：结合了 13 C代谢组学、蛋白质组学和代谢通量分析，全面解析了微生物代谢途径。 2.底物依赖性CUE：明确了不同底物通过不同代谢途径导致CUE变异的机制。 3.代谢途径解析：详细揭示了糖类和芳香族底物在代谢网络中的分配及其对CO 2 排放和生物质合成的影响。 微生物有机质的转化是陆地二氧化碳(CO 2 )预算的重要贡献者。将有机碳转化为生物质与CO 2 排放的比例，称为碳利用效率(CUE)，广泛用于表征土壤微生物对有机碳的循环。近期研究挑战了CUE依赖于底物碳的氧化态的提议，反而暗示了代谢策略的作用。然而，CUE变异背后的代谢机制尚不清楚。我们对假单胞菌(Pseudomonas putida)进行了多组学研究，这是一种多功能的土壤细菌，能够处理植物残留物衍生物的混合物。我们的 13 C代谢组学数据显示，纤维素衍生的糖类碳进入糖
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