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算不上什么大错误的成纤维细胞亚群的细分操作

单细胞天地  · 公众号  ·  · 2024-09-29 20:00
    

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针对这个这个胃癌单细胞数据集GSE163558,我做了解读,详见 : 单细胞转录组降维聚类分群过滤基因和过滤细胞的区别 。而且前面已经是完成了降维聚类分群,在 学习单细胞亚群命名的层次结构 演示了一个降维聚类分群结果,就有了  2-harmony/sce.all_int.rds 文件,以及对应的 phe.Rdata 注释信息。 既然  单细胞亚群取子集后的细分亚群再命名的两个难题 ,b细胞和髓系都是有比较好的生物学背景知识整理,但是成纤维就是一个例外,让我们看看这个文章做的怎么样吧! 然后我强调了其实我们的第一层次降维聚类分群里面的 成纤维细胞是一个混合物 ,里面混入了平滑肌细胞(Smooth Muscle Cells, SMCs)和周细胞(Pericytes),这个混合的单细胞亚群可以被称为“混合间充质细胞群”(Mixed Mesenchymal Cell Cluster)或“血管相关间充质细胞群”(Vascular-Associated Mesen ………………………………

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